审计人员在实质性测试阶段的工作流程主要包括以下步骤：

制定具体测试计划：

明确测试目标：根据初步调查和风险评估的结果，确定实质性测试要验证的具体目标，比如确认财务报表中某一账户余额的准确性、某类交易的合法性等。

确定测试范围：依据审计的重要性水平和风险评估，决定对哪些账户、交易或项目进行实质性测试，以及测试的样本量和涵盖的时间段。例如，对于金额较大、交易频繁或风险较高的账户，会加大测试的样本量和关注程度。

选择测试方法：根据不同的审计目标和被审计单位的具体情况，选择合适的实质性测试方法，如检查、观察、函证、重新计算、分析性复核等。

实施具体测试程序：

比率分析：计算一些关键的财务比率，如流动比率、资产负债率、毛利率等，并与同行业的平均水平或被审计单位以往年度的比率进行比较，分析是否存在异常波动。如果比率异常，需要进一步调查原因，判断是否存在财务报表舞弊或其他风险。

趋势分析：分析被审计单位财务数据在一段时间内的变化趋势，如收入、利润、资产等的增长或下降情况，了解其业务的发展状况和财务状况的稳定性。

函证：向被审计单位的往来客户、供应商等发送函证，确认应收账款、应付账款等债权债务的余额是否正确。函证的方式可以是积极式函证（要求对方明确回复是否认可函证上的金额）或消极式函证（仅在对方有异议时才回复），根据具体情况选择合适的函证方式。

替代程序：如果无法取得函证的回函，或者对回函的结果不满意，审计人员需要实施替代程序，如检查相关的合同、发票、付款凭证等，以获取足够的审计证据来验证债权债务的真实性和准确性。

实物资产盘点：对有形资产，如库存现金、存货、固定资产等进行实地盘点。盘点时，审计人员需要亲自参与，确保盘点的准确性和完整性。对于存货，还需要关注其计价方法是否正确，是否存在积压、过期等情况；对于固定资产，要检查其使用状况、折旧计提是否合理。

资产所有权确认：核实资产的所有权是否归被审计单位所有，检查相关的产权证明文件，如房产证、车辆行驶证等。对于存在抵押、质押等情况的资产，要确认相关的手续是否合法合规。

凭证检查：抽查一定比例的会计凭证，查看凭证上的审批手续是否齐全，交易的内容、金额是否与原始单据相符，会计处理是否正确。例如，检查销售业务的发票、出库单、销售合同等是否一致。

合同审查：对于重大的交易合同，仔细审查合同的条款、签订日期、交易双方的权利义务等内容，确认交易的真实性和合法性。同时，关注合同的执行情况，是否按照合同约定的条款进行交易和结算。

加总核对：将相关明细账户的余额进行加总，与总账余额进行比较，检查二者是否一致。如果出现差异，需要进一步追查原因，确认是否存在记账错误或其他异常情况。

明细账审查：仔细审查明细账中的每一笔记录，包括交易的日期、金额、摘要等信息，检查其是否符合会计准则和公司内部的财务制度，是否有足够的原始凭证支持。

账户余额的核对与审查：

交易的真实性与合法性审查：

资产的实地盘点与核实：

债权债务的函证与核实：

财务数据的分析性复核：

收集和评价审计证据：

证据收集：在实施实质性测试的过程中，审计人员要收集各种审计证据，包括书面文件、实物证据、口头证据等。证据的收集要遵循客观性、相关性、充分性和合法性的原则，确保所收集的证据能够支持审计结论。

证据评价：对收集到的审计证据进行评价，判断其可靠性、相关性和充分性。对于存在疑问或矛盾的证据，需要进一步核实和调查。如果发现审计证据不足以支持审计结论，需要补充收集证据或重新实施测试程序。

形成审计结论：

汇总测试结果：将各个测试项目的结果进行汇总，分析被审计单位的财务状况和经营成果是否真实、合法、完整。对于发现的问题和异常情况，要进行深入分析和判断，确定其对财务报表的影响程度。

得出审计结论：根据汇总的测试结果和分析判断，得出审计人员对被审计单位财务报表的审计结论。审计结论可以是无保留意见、保留意见、否定意见或无法表示意见，具体的结论类型取决于审计过程中发现的问题的严重程度和对财务报表的影响程度