厦门企业中长期外债备案申请的流程主要包括以下几个步骤：

深入了解政策：企业需要全面了解国家和地方关于外债管理的政策法规，特别是中长期外债备案登记的相关规定。这包括了解新的法规更新和通知，以确保备案过程符合政策要求。

自我评估与规划：企业应对自身的资金需求、债务承受能力进行全面评估，合理确定外债的规模、用途、期限、利率等基本要素。同时，需确保外债资金用途符合国家产业政策和发展方向。

根据《企业借用外债备案登记办事指南》及相关政策要求，企业需要准备以下申请材料：

企业基本材料：

营业执照副本及复印件

公司章程及修正案（如有）

企业法定代表人身份证明文件及复印件

组织机构代码证（如适用）

财务相关资料：

经审计的近三年财务报表（资产负债表、利润表、现金流量表等）

近一期的财务报表（如有）

企业信用报告（如有要求）

外债相关文件：

外债借款合同或意向书（明确借款金额、期限、利率、用途、还款方式等关键条款）

外债发行方案（包括外债币种、规模、利率、期限、募集资金用途及资金回流情况等）

还款计划及相关证明文件

其他必要文件：

董事会或股东会关于申请外债的决议文件

若有担保情况，需提供担保合同或意向书以及担保人的相关资料

企业发行外债真实性承诺函

项目可行性研究报告（如外债用于特定项目）

选择提交方式：企业可以通过企业外债备案登记管理和服务网络系统线上提交申请，也可以按照要求将纸质版材料报送至所在地外汇管理局。

填写申请表格：按照系统要求或模板准确无误地完成所有必要表格的填写工作。

形式审查：政务服务大厅收到全部申请材料后，窗口工作人员将对申请材料进行形式审查，确保材料的完整性和规范性。如材料存在内容错漏，承办部门将通过网上系统向申请人发出补齐补正通知。

实质审查：外汇管理部门将根据材料的真实性和合规性进行审核。审核过程中，可能会要求企业提供额外的信息或解释。

审核结果：审核通过后，审核机关将作出批准决定，并出具《企业借用外债备案登记证明》。该证明是企业后续使用外债资金的重要依据。如审核不通过，将出具不予审核登记书面通知，并说明理由。

合规使用资金：企业在获得备案登记后，应严格按照批准的用途使用外债资金，并按时还本付息。

定期报告：企业需按时向监管机构报告外债的使用情况以及还本付息进度。

风险管理：企业应建立健全的风险管理体系，保障债务的安全性和可持续性。在外债存续期间，企业应持续关注相关法律法规的变化，并确保自身行为始终合规。