南京企业中长期外债备案发改委的流程如下：

1. 前期准备：

2. 明确需求与目的：企业深入分析借取中长期外债的原因，如扩大生产规模、技术研发、开拓国际市场或并购重组等，合理规划外债额度和用途。

3. 自我评估与财务规划：全面评估自身财务状况，查看资产负债表、利润表和现金流量表等，分析资产结构、负债水平、盈利能力以及现金流的稳定性。根据借款需求和未来经营预期，制定详细的财务规划，预测借取外债后的财务状况变化，确保具备足够的偿债能力按时偿还外债本息。

4. 研究政策法规：认真研究国家和地方关于外债管理的政策法规，了解外债备案登记的条件、流程、所需材料以及监管要求等。

5. 材料准备：

6. 基本证照：企业法人营业执照、组织机构代码证、税务登记证（已完成三证合一的企业提供统一社会信用代码证）。

7. 融资相关材料：银行授信文件、外债计划、还本付息计划等。

8. 发行外债的申请报告与发行方案：包括外债币种、规模、利率、期限、募集资金用途及资金回流情况等。

9. 财务报告：需经过审计机构审计的近三年及近一期财务报告，包括资产负债表、利润表、现金流量表等，以证明企业的财务状况和偿债能力。

10. 资金用途说明：详细具体的资金用途说明，包括项目审批、核准或备案情况（如有）、收购合同或意向书签订情况（如有）等，要具有可行性和合理性。

11. 其他材料（如有需要）：申请境外发行债券的，需提供承销机构出具的尽职调查报告和真实性承诺函，以及专业机构出具的法律意见和真实性承诺函；如有担保，还需提供担保合同或意向书以及企业及其控股股东、实际控制人近三年不存在重大违法违规行为的声明。

12. 线上注册及申报：自 2020 年 11 月 1 日起，企业申请中长期外债备案登记、信息报送、重大事项报告、应询反馈等均通过国家发展改革委建立的网络系统进行办理。具体步骤为：

13. 登录系统：企业需进入国家发展改革委门户网站 “政务服务” 频道或指定的网络系统进行注册和登录。

14. 填写申请：按照系统要求，完整、准确、如实地填报相关信息，并上传准备好的备案材料。

15. 提交纸质材料（如有需要）：对于不适宜使用网络系统的事项，企业可以选择使用纸质材料提交。网上申报指南由国家发展改革委发布，企业应提前了解并遵循这些指南。提交时应确保材料的真实性和完整性。

16. 审核与反馈：

17. 形式审查：政务服务大厅收到申请材料后，窗口工作人员会对申请材料进行形式审查，审查合格的予以接收。

18. 复审与受理：承办司局收到申请材料后，会对申请材料进行复审，审查合格的予以受理。审核时间通常会在一定时间内（如 3 个月内）完成，对于需要补充材料的，会及时通知企业进行补充。

19. 公示信息：审核通过后，国家发改委将在其门户网站上公示企业的备案信息，包括企业名称、融资额度、期限、利率等关键要素。

20. 取得备案证明：若企业的备案申请获得批准，相关部门将出具备案证明，如《企业借用外债备案登记证明》。

21. 后续管理：

22. 发行或提款后报送：企业应在每期发行或提款结束后 10 个工作日内，向国家发改委报送发行或提款信息。

23. 定期报送：企业还应于每年 1 月末和 7 月末前 5 个工作日内，报送外债资金使用情况、本息兑付情况和计划安排等信息。

24. 重大情况报送：如出现境内外债务偿付风险或重大资产重组等可能影响债务正常履约的重大情况，企业应及时报送有关信息并采取风险隔离措施，防范境内债券违约风险外溢和交叉违约风险。